git add は「commitすべき内容をaddする」という意味。ファイルの新規追加ではない場合にも使う。

git status で検出される変更は git add . するとステージングしてくれる。

ただしファイルを削除したことをcommitしたければ「git rm (filename)」を使う。

ファイル名を付け替えたときに

git add 新しいファイル名 
git rm 古いファイル名 

を実行すると、 git status したときに

renamed: 古いファイル名 -> 新しいファイル名

のように解釈される。

git status で複数のファイルが modified （または added ）のときに、特定のファイルだけをコミットする：

git commit -m "comment" filename

すべての modified （および added ）な状態のファイルをコミットする：

git commit -a -m "comment"  

since 2012-04-17

git add してから git commit する前に、add を取り消す：

git rm --cached ファイル名

git status するとこの説明が出てくる。